В недалёком будущем люди массово заменяют части тела кибернетическими имплантами, а корпорация Hanka Robotics тайно создаёт полностью механическое тело, подключённое к человеческому мозгу. В результате эксперимента появляется Майор — боевой агент отдела по борьбе с киберпреступностью Section 9, который почти ничего не помнит о своём прошлом. Расследуя серию атак и охоту на террориста по имени Кудзэ, она постепенно узнаёт правду о корпорации и о собственном происхождении.